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Equipe da Univates identifica mutações no genoma do SARS-CoV-2, vírus causador da Covid-19

Timmers / Crédito da foto: Divulgação

Um grupo de pesquisadores da Universidade do Vale do Taquari – Univates liderados pelo professor doutor Luis Fernando Saraiva Macedo Timmers realizou a análise de 627 genomas do SARS-CoV-2, vírus causador da Covid-19, isolados de indivíduos de diferentes regiões do Brasil. 

Durante o trabalho, os pesquisadores combinaram análises de genômica e bioinformática estrutural para avaliar a presença de mutações no genoma de SARS-CoV-2, com o objetivo de demonstrar quais são e onde, na estrutura do vírus, estão as mutações mais prevalentes.

O estudo expande o conhecimento sobre a interação do vírus da Covid-19 com o organismo humano. 

Objetivos do trabalho 

O principal objetivo do estudo foi avaliar a presença de mutações no genoma do SARS-CoV-2 isolados em diferentes regiões do Brasil. “Nós vemos muitas notícias de mutações sendo notificadas em outros lugares do mundo e, à altura, havia poucas informações sobre o Brasil. Já existem mudanças no genoma de SARS-CoV-2 circulando por aqui? Em caso positivo, quais são os genes que apresentam as maiores taxas de mutações?”, essas foram perguntas que guiaram o estudo, diz Timmers.

Os dados para este estudo foram obtidos por meio do banco de dados público GISAID.

Esquema que demonstra as etapas do estudo / Crédito da foto: Divulgação

Resultados

Os resultados demonstraram que grande parte das mutações foram observadas em quatro proteínas virais: (i) Spike, (ii) nucleocapsídeo, (iii) ORF3a e (iv) ORF6. Essas proteínas estão envolvidas em diferentes estágios do ciclo viral, assim como no processo de  interação com as células humanas.

Um ponto que chamou a atenção dos pesquisadores foi a presença de diferentes mutações na região da proteína Spike – responsável por reconhecer a célula humana e iniciar o processo de infecção pelo vírus. 

Para chegar às respostas a equipe combinou diversas técnicas computacionais como  a bioinformática estrutural e a genômica comparativa. Desta forma, foi possível observar que as mutações estavam acontecendo, sim.

A análise estrutural realizada durante a pesquisa trouxe luz às posições em que as alterações acontecem nas proteínas virais, o que pode auxiliar estudos sobre a descoberta de medicamentos baseados em estrutura (structure-based drug discovery), no desenvolvimento de vacinas, assim como, o impacto dessas variações na eficácia das vacinas atuais.

“Uma vez identificadas as mutações, observamos onde elas estavam localizadas na estrutura das proteínas virais”, diz o docente.  

Os dados dos genomas estudados estão em bancos de dados públicos, de onde as amostras coletadas vieram e nas quais estudos como o da Univates ainda não haviam sido realizados.

Timmers defende a importância de se conhecer a existência de mutações em curso no vírus, quais são e onde estão localizadas. 

“Especialmente neste momento de desenvolvimento de vacinas é essencial que se conheça mais”. Casos em que mutações influenciam os efeitos da vacina já foram verificados.

“A neutralização viral induzida pela vacina da Oxford/AstraZeneca, parece ser significativamente reduzida contra a variante B.1.351, identificada na África do Sul”, lembra o docente.

Quanto mais o vírus circula, maior as chances de ocorrerem mutações no genoma viral. “Desta forma, mesmo com o início do processo de vacinação, ainda são extremamente importantes manter as medidas de higienização, uso de máscara e distanciamento social”, finaliza o pesquisador.

Parceria

Timmers explica que a investigação foi delineada na Instituição, numa parceria dele com os professores doutor. João Antônio Pêgas Henriques e a doutora Márcia Goettert – que, no momento, está na Universidade de Tübingen, na Alemanha, pesquisando o desenvolvimento de novos testes para detecção de SARS-CoV-2. 

Além dos professores da Univates, a pesquisa contou com a colaboração de mais seis instituições: a Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), a Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre (UFCSPA), a Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), a Universidade Federal de Pelotas (UFPel), a Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) e a Universidade de Tübingen. 

O artigo está publicado no formato preprint – ou seja, pré-publicado -, na revista ChemRxiv. Aqui http://bit.ly/pesquisa-genoma-univates é possível acessar o conteúdo integral da publicação da Univates.

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